Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Dnajb6O54946 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajb6O54946 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms