Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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ColqO35348 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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ColqO35348 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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ColqO35348 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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ColqO35348 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ColqO35348 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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ColqO35348 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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ColqO35348 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ColqO35348 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ColqO35348 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ColqO35348 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ColqO35348 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ColqO35348 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ColqO35348 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ColqO35348 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ColqO35348 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ColqO35348 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms