Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kpna3O35344 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms