Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad6O35182 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms