Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pitx3O35160 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms