Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms