Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cldn34c3J3QJW5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cldn34c3J3QJW5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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