Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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