Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-1G3UXB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms