Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1bF6V0H0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1bF6V0H0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms