Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A2

Gm38392, Predicted gene, 38392 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm38392E9Q2A2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm38392E9Q2A2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms