Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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