Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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