Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms