Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms