Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms