Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PtprsB0V2N1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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