Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttll9A2APC3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttll9A2APC3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms