Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprfA2A8L5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms