Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms