Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt85Q9Z2T6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt85Q9Z2T6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt85Q9Z2T6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms