Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms