Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms