Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hacd1Q9QY80 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hacd1Q9QY80 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms