Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Med27Q9DB40 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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