Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms