Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms