Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp12Q9D9M2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp12Q9D9M2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp12Q9D9M2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp12Q9D9M2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp12Q9D9M2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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