Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms