Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms