Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms