Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms