Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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