Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms