Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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