Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms