Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms