Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.6 ms