Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rpa3Q9CQ71 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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