Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms