Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl1Q99N96 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms