Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tdrd1Q99MV1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms