Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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