Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms