Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms