Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms