Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms