Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps4aQ8VEJ9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms