Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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