Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms